Катедра „Биотехнология” е катедра с традиции в обучението на студенти в сферата  на биотехнологиите. През 1963 година в УХТ за пръв път в България е организирано обучение на студенти в областта на биотехнологиите, като тогава специалността се е наричала „Технология на биопрепарати, витамини и дрожди”. През 1973 г. името на специалността е променено на „Технология на микробиологичните и ферментационни продукти”, а през 1984 г. след утвърждаването на нови учебни планове се създава и ново направление – Биотехнологии, включващо новата специалност „Технология на биопроизводствата”.

С решение на АС от 1991 г. е създадена профилираща катедра Биотехнология. През 1992 г., след въвеждане на нова структура на специалностите в УХТ, специалността се нарича „Технология на биопродуктите”, а от 1997 г. досега названието на специалността е „Биотехнологии”. От 2002 г. в съответствие със Закона за висшето образование, в УХТ започва обучение по двете образователно – квалификационни степени – „Бакалавър” по специалност „Биотехнологии” и „Магистър” по специалност „Индустриални биотехнологии”. От 2015 година по „Клетъчна и молекулярна биотехнология” и от 2018 по „Индустриални и фармацевтични биотехнологии”. През 2024 г. стартира обучението по нова програма за ОКС Бакалавър „Хранителни и фармацевтични биотехнологии“.

Дипломираните, след успешно положен държавен изпит, студенти от ОКС Бакалавър и ОКС Магистър са над 900, като около 60 от тях са чуждестранни – от Европа, Азия, Латинска Америка и Африка. По научното направление „Технология на биологично активните вещества” успешно са защитили своя дисертационен труд над 50 аспиранта.

От създаването си, катедра „Биотехнология” осъществява активно международно сътрудничество с чуждестранни висши училища от САЩ, Европа, Азия и др. Над 10 студента са били част от програма TEMPUS за частично обучение в университети в ЕС. Освен това всяка година 3-5 студента от катедрата имат възможност да участват в обучения по програма Erasmus в Италия, Франция, Германия, Япония, Гърция, Португалия, Индия, Ирландия и др.

1. Имобилизирани микробни клетки, ASK, 1995., Кръстанов А.

2. Промишлена ензимология, ВИХВП, 1997, Гаргова С., Кръстанов А.

3. Ръководство за лабораторни упражнения по ензими, УХТ – Пловдив, 2008, Гаргова С., Кръстанов А., Стоилова И.

4. Ръководство по химия и технология на хранителните среди в биотехнологичните производства, изд. Жовали, Пловдив, 2000, Ангел Ангелов, Златка Рошкова

5. Биотехнологични производства, Пловдив, 2000, Гаргова Ст., Кожухарова Л., Бахчеванска С.

6. Технология на микробни белтъчни продукти. Web-базиран електронен учебник. Виртуална библиотека УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов А., Гочева В.

7. Химия и технология на хранителните среди в биотехнологичните производства. Web-базиран електронен учебник. Виртуална библиотека УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов А., Гочева В.

8. Хранителна биотехнология. Web-базиран електронен учебник. Виртуална библиотека УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов А., Гочева В.

9. Технологично обзавеждане в биотехнологичната промишленост, УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов М., Костов Г.

10. Разделяне и анализ на биопродукти. Издателство Агенция седем Д, Пловдив, 2012, ISBN 978-954-9774-32-0, Кръстанов, А., Славчев А.

11. Биологично активни вещества – изолиране, разделяне и анализ, Ръководство за лабораторни упражнения, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2014, ISBN 978-954-24-0245-9, Михайлова Д., Кръстанов А.

12. Практикум по ензимология. Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2015, Кръстанов, А.

13. Биотехнологични методи в екологията, Ръководство за лабораторни упражнения, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2021, ISBN 978-954-24-0345-6, Ангелова Г., Бръзкова М.

Профилиращите дисциплини, които се изучават и са характерни за катедрата са:

Бакалавърска програма „Хранителни и фармацевтични биотехнологии”:

Клетъчна биология;

Биотехнология на витамините;

Основи на биокатализата;

Молекулярна биология;

Ензими в хранителната и фармацевтичната промишленост;

Биоактивни фармакологични метаболити;

Промишлена микробиология;

Биотехнология на ферментационни храни и напитки;

Хигиенен дизайн при производствата на хранителни и биотехнологични продукти;

Микробни биомаси и алтернативни протеини;

Биотехнология на антибиотиците;

Биотехнологични процесии съоръжения;

Растителна клетъчна агрономия;

Разделяне и анализ на биопродукти;

Агробиопродукти;

Екобиотехнология и кръгова икономика;

Биотехнология на ваксини;

Биоингредиенти и функционални храни;

Молекулярно-генетични анализи;

Магистърска програма „Индустриални  и фармацевтични  биотехнологии”:

Рекомбинантни ДНК технологии

Биотехнология на клетъчните и тъканни култури

Кинетика и управление на биопроцесите

Биофармацевтични производства

Микробиологичен контрол на хранителни и фармацевтични  продукти

Микробни популации и асоциации

Инженерна ензимология

Анализ на фармацевтични продукти

Магистърска програма „Клетъчна и молекулярна биотехнология”:

Имунология

Молекулярна биология

Вирусология

Рекомбинантни ДНК технологии

Геномика и протеомика

Метаболомика и аквафотомика

Микробна екология

Нанобиотехнологии

Приложна биокатализа и биосензори

Молекулярно-генетични методи за анализ и контрол

Пробиотици и микробиомни съобщества