Катедра  “Микробиология” е създадена през 1951 г. към Технологичния факултет на ВСИ “В. Коларов”, Пловдив. Неин основоположник е чл.кор. Илия Пашев /доцент по това време/. Заедно с проф. Милен Бешков /негов асистент/ създават материалната база на катедрата и организират учебната и научноизследователската работа. През следващите години катедрата се превръща в едно от най-големите и мощни микробиологични звена в страната. През 60-те години на миналия век колективът от преподаватели, научни сътрудници, специалисти и аспиранти надхвърля 40 души. До 1998 г. в катедрата са обучени над 11 000 студенти, докторанти (над 30), специализанти, дипломанти, много кръжочници и др. Студентите получават познания по обща, хранителна и промишлена микробиология, по генетика и селекция на микроорганизмите. От 1963 г. до 1991 г. в катедрата се съвместяват заедно обучението по обща микробиология на всички студенти от Технологичния факултет и специалността „Биотехнология“. Тук за пръв път в страната се въвежда биотехнологично обучение. Особено внимание се обръща на следдипломната квалификация и на първо място на докторантурата. Разработват се нови съвременни микробиологични и биотехнологични методи, внедряват се нови технологии. Осъществява се непосредствена връзка между наука и обучение. Разрешени са и се решават важни теоретични въпроси в областта на микробиологията и генетиката и научно-приложни проблеми, свързани с хранителната, фармацевтичната, етерично-маслената, козметичната и други промишлености. В катедрата са разработени методи за микробиологичен анализ и контрол на храни и напитки.

Катедрата е ръководена последователно от проф. И. Пашев, проф. М. Бешков, проф. Е. Карова, проф. И. Мургов, проф. Л. Купенов. През 2001 г чрез сливането на катедра “Органична химия” и на катедра “Микробиология” е създадена обединена катедра „Органична химия и микробиология”. За ръководител на общата катедра е избран проф. И. Мургов. През 2004 г катедрата става водеща за специалността “Химия и микробиология на храните” за студенти с образователно-квалификационната степен “бакалавър”. От 2012 г. от обединената катедра са възстановени двете катедри: „Органична химия” и „Микробиология”. През 2013 г. към катедрата е разкрита специалността „Функционални храни“ от образователно-квалификационната степен „магистър“.

Катедра „Биотехнология” е катедра с традиции в обучението на студенти в сферата  на биотехнологиите. През 1963 година в УХТ за пръв път в България е организирано обучение на студенти в областта на биотехнологиите, като тогава специалността се е наричала „Технология на биопрепарати, витамини и дрожди”. През 1973 г. името на специалността е променено на „Технология на микробиологичните и ферментационни продукти”, а през 1984 г. след утвърждаването на нови учебни планове се създава и ново направление – Биотехнологии, включващо новата специалност „Технология на биопроизводствата”.

С решение на АС от 1991 г. е създадена профилираща катедра Биотехнология. През 1992 г., след въвеждане на нова структура на специалностите в УХТ, специалността се нарича „Технология на биопродуктите”, а от 1997 г. досега названието на специалността е „Биотехнологии”. От 2002 г. в съответствие със Закона за висшето образование, в УХТ започва обучение по двете образователно – квалификационни степени – „Бакалавър” по специалност „Биотехнологии” и „Магистър” по специалност „Индустриални биотехнологии”. От 2015 година по „Клетъчна и молекулярна биотехнология” и от 2018 по „Индустриални и фармацевтични биотехнологии”. През 2024 г. стартира обучението по нова програма за ОКС Бакалавър „Хранителни и фармацевтични биотехнологии“.

Дипломираните, след успешно положен държавен изпит, студенти от ОКС Бакалавър и ОКС Магистър са над 900, като около 60 от тях са чуждестранни – от Европа, Азия, Латинска Америка и Африка. По научното направление „Технология на биологично активните вещества” успешно са защитили своя дисертационен труд над 50 аспиранта.

От създаването си, катедра „Биотехнология” осъществява активно международно сътрудничество с чуждестранни висши училища от САЩ, Европа, Азия и др. Над 10 студента са били част от програма TEMPUS за частично обучение в университети в ЕС. Освен това всяка година 3-5 студента от катедрата имат възможност да участват в обучения по програма Erasmus в Италия, Франция, Германия, Япония, Гърция, Португалия, Индия, Ирландия и др.

1. Мургов И., З.Денкова – Микробиология – учебник за техникуми, І издание, Нова Тимкомпакт, Пловдив, 2001 г.
2. Мургов И., З.Денкова – Микробиология –  учебник за техникуми, ІІ издание, изд. Нова Тимкомпакт, Пловдив, 2001 г.
3. Мургов И., З.Денкова – Микробиология – учебник за ВУЗ – І издание, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2004 г.
4. Мургов И., З.Денкова – Генетика и селекция на микроорганизмите – учебник за ВУЗ, І издание, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2007 г. ISBN: 978-954-24-0083-7.
5. Мургов И., З.Денкова – Микробиология – учебник за ВУЗ, IV преработено и допълнено издание,  Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2012 г.
6. Ivanova V., Base theorique sur les travaux pratiques en microbiologie, Университетско издателство „П. Хилендарски“, 2014 г., ISBN 978-954-423-932-9.
7. Денкова З., Р. Денкова, В. Янакиева, И. Добрев – Хранителна микробиология. Ръководство за упражнения, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2015 г. ISBN 978-954-24-0270-1 print / ISBN 978-954-24-0269-5 e-book.
8. Тумбарски, Ю. – Ветеринарно-санитарен контрол на хранителните суровини и продукти, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2017 г.
9. Денкова З., Р. Денкова, Г. Костов, Б. Горанов, Д. Тенева – Хранителна микробиология, Университетско издателство на УХТ, Пловдив, 2018 г., ISBN 978-954-24-0299-2.
   
   
   1. Имобилизирани микробни клетки, ASK, 1995., Кръстанов А.
   2. Промишлена ензимология, ВИХВП, 1997, Гаргова С., Кръстанов А.
   3. Ръководство за лабораторни упражнения по ензими, УХТ – Пловдив, 2008, Гаргова С., Кръстанов А., Стоилова И.
   4. Ръководство по химия и технология на хранителните среди в биотехнологичните производства, изд. Жовали, Пловдив, 2000, Ангел Ангелов, Златка Рошкова
   5. Биотехнологични производства, Пловдив, 2000, Гаргова Ст., Кожухарова Л., Бахчеванска С.
   6. Технология на микробни белтъчни продукти. Web-базиран електронен учебник. Виртуална библиотека УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов А., Гочева В.
   7. Химия и технология на хранителните среди в биотехнологичните производства. Web-базиран електронен учебник. Виртуална библиотека УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов А., Гочева В.
   8. Хранителна биотехнология. Web-базиран електронен учебник. Виртуална библиотека УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов А., Гочева В.
   9. Технологично обзавеждане в биотехнологичната промишленост, УХТ, Пловдив, 2010, Ангелов М., Костов Г.
   10. Разделяне и анализ на биопродукти. Издателство Агенция седем Д, Пловдив, 2012, ISBN 978-954-9774-32-0, Кръстанов, А., Славчев А.
   11. Биологично активни вещества – изолиране, разделяне и анализ, Ръководство за лабораторни упражнения, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2014, ISBN 978-954-24-0245-9, Михайлова Д., Кръстанов А.
   12. Практикум по ензимология. Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2015, Кръстанов, А.
   13. Биотехнологични методи в екологията, Ръководство за лабораторни упражнения, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2021, ISBN 978-954-24-0345-6, Ангелова Г., Бръзкова М.

В катедрата се извеждат следните основни дисциплини:

• Микробиология
• Хранителна микробиология
• Генетика и селекция на микроорганизмите
• Безопасност на храните
• Микробиологичен анализ и контрол
• Микробни хранителни технологии
• Ветеринарно-санитарен контрол на хранителните суровини и продукти
• Технология на пробиотици, пребиотици и синбиотици
• Криобиология
• Функционални храни и здравословно хранене
• Функционални хранителни добавки
• Безопасност на храните и хранително законодателство
• Пробиотични функционални храни и напитки
• Функционални храни от животински произход
• Микробиологичен анализ и контрол на функционални храни
• Микробиологичен анализ и контрол на храните
• Технологично обзавеждане
• Кинетика и управление на биопроцесите
• Вирусология

Методика на научните изследвания

Профилиращите дисциплини, които се изучават и са характерни за катедрата са:

• Бакалавърска програма „Хранителни и фармацевтични биотехнологии”:
• Клетъчна биология;
• Биотехнология на витамините;
• Основи на биокатализата;
• Молекулярна биология;
• Ензими в хранителната и фармацевтичната промишленост;
• Биоактивни фармакологични метаболити;
• Промишлена микробиология;
• Биотехнология на ферментационни храни и напитки;
• Хигиенен дизайн при производствата на хранителни и биотехнологични продукти;
• Микробни биомаси и алтернативни протеини;
• Биотехнология на антибиотиците;
• Биотехнологични процесии съоръжения;
• Растителна клетъчна агрономия;
• Разделяне и анализ на биопродукти;
• Агробиопродукти;
• Екобиотехнология и кръгова икономика;
• Биотехнология на ваксини;
• Биоингредиенти и функционални храни;
• Молекулярно-генетични анализи;
• Магистърска програма „Индустриални  и фармацевтични  биотехнологии”:
• Рекомбинантни ДНК технологии
• Биотехнология на клетъчните и тъканни култури
• Кинетика и управление на биопроцесите
• Биофармацевтични производства
• Микробиологичен контрол на хранителни и фармацевтични  продукти
• Микробни популации и асоциации
• Инженерна ензимология
• Анализ на фармацевтични продукти
• Магистърска програма „Клетъчна и молекулярна биотехнология”:
• Имунология
• Молекулярна биология
• Вирусология
• Рекомбинантни ДНК технологии
• Геномика и протеомика
• Метаболомика и аквафотомика
• Микробна екология
• Нанобиотехнологии
• Приложна биокатализа и биосензори
• Молекулярно-генетични методи за анализ и контрол
• Пробиотици и микробиомни съобщества