Катедра  “Микробиология” е създадена през 1951 г. към Технологичния факултет на ВСИ “В. Коларов”, Пловдив. Неин основоположник е чл.кор. Илия Пашев /доцент по това време/. Заедно с проф. Милен Бешков /негов асистент/ създават материалната база на катедрата и организират учебната и научноизследователската работа. През следващите години катедрата се превръща в едно от най-големите и мощни микробиологични звена в страната. През 60-те години на миналия век колективът от преподаватели, научни сътрудници, специалисти и аспиранти надхвърля 40 души. До 1998 г. в катедрата са обучени над 11 000 студенти, докторанти (над 30), специализанти, дипломанти, много кръжочници и др. Студентите получават познания по обща, хранителна и промишлена микробиология, по генетика и селекция на микроорганизмите. От 1963 г. до 1991 г. в катедрата се съвместяват заедно обучението по обща микробиология на всички студенти от Технологичния факултет и специалността „Биотехнология“. Тук за пръв път в страната се въвежда биотехнологично обучение. Особено внимание се обръща на следдипломната квалификация и на първо място на докторантурата. Разработват се нови съвременни микробиологични и биотехнологични методи, внедряват се нови технологии. Осъществява се непосредствена връзка между наука и обучение. Разрешени са и се решават важни теоретични въпроси в областта на микробиологията и генетиката и научно-приложни проблеми, свързани с хранителната, фармацевтичната, етерично-маслената, козметичната и други промишлености. В катедрата са разработени методи за микробиологичен анализ и контрол на храни и напитки.

Катедрата е ръководена последователно от проф. И. Пашев, проф. М. Бешков, проф. Е. Карова, проф. И. Мургов, проф. Л. Купенов. През 2001 г чрез сливането на катедра “Органична химия” и на катедра “Микробиология” е създадена обединена катедра „Органична химия и микробиология”. За ръководител на общата катедра е избран проф. И. Мургов. През 2004 г катедрата става водеща за специалността “Химия и микробиология на храните” за студенти с образователно-квалификационната степен “бакалавър”. От 2012 г. от обединената катедра са възстановени двете катедри: „Органична химия” и „Микробиология”. През 2013 г. към катедрата е разкрита специалността „Функционални храни“ от образователно-квалификационната степен „магистър“.

1. Мургов И., З.Денкова – Микробиология – учебник за техникуми, І издание, Нова Тимкомпакт, Пловдив, 2001 г.
2. Мургов И., З.Денкова – Микробиология –  учебник за техникуми, ІІ издание, изд. Нова Тимкомпакт, Пловдив, 2001 г.
3. Мургов И., З.Денкова – Микробиология – учебник за ВУЗ – І издание, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2004 г.
4. Мургов И., З.Денкова – Генетика и селекция на микроорганизмите – учебник за ВУЗ, І издание, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2007 г. ISBN: 978-954-24-0083-7.
5. Мургов И., З.Денкова – Микробиология – учебник за ВУЗ, IV преработено и допълнено издание,  Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2012 г.
6. Ivanova V., Base theorique sur les travaux pratiques en microbiologie, Университетско издателство „П. Хилендарски“, 2014 г., ISBN 978-954-423-932-9.
7. Денкова З., Р. Денкова, В. Янакиева, И. Добрев – Хранителна микробиология. Ръководство за упражнения, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2015 г. ISBN 978-954-24-0270-1 print / ISBN 978-954-24-0269-5 e-book.
8. Тумбарски, Ю. – Ветеринарно-санитарен контрол на хранителните суровини и продукти, Академично издателство на УХТ, Пловдив, 2017 г.
9. Денкова З., Р. Денкова, Г. Костов, Б. Горанов, Д. Тенева – Хранителна микробиология, Университетско издателство на УХТ, Пловдив, 2018 г., ISBN 978-954-24-0299-2.

В катедрата се извеждат следните основни дисциплини:

• Микробиология
• Хранителна микробиология
• Генетика и селекция на микроорганизмите
• Безопасност на храните
• Микробиологичен анализ и контрол
• Микробни хранителни технологии
• Ветеринарно-санитарен контрол на хранителните суровини и продукти
• Технология на пробиотици, пребиотици и синбиотици
• Криобиология
• Функционални храни и здравословно хранене
• Функционални хранителни добавки
• Безопасност на храните и хранително законодателство
• Пробиотични функционални храни и напитки
• Функционални храни от животински произход
• Микробиологичен анализ и контрол на функционални храни
• Микробиологичен анализ и контрол на храните
• Технологично обзавеждане
• Кинетика и управление на биопроцесите
• Вирусология
• Методика на научните изследвания